کتاب «الگوی تربیت جامع طلاب» گامی در جهت ترسیم الگوی مطلوب تربیت طلاب، به همت مدیران مدارس علمیه حضرت مهدی(عج)، تحت اشراف حجتالاسلاموالمسلمین نظافت یزدی تدوین شده است. در نگارش این الگو از آیات قرآن کریم، روایات اهلبیت(ع)، منویات مقام معظم رهبری(حفظ الله) و سالها تجربه تربیت طلاب در مدارس علمیه حضرت مهدی(عج) و تجربههای موفق اجرا شده در سایر مدارس علمیه، بهرههای فراوان برده شده است. در فصل نخست این کتاب، پس از بیان مبانی و ضرورتِ تربیت، به لزوم جامعیت در تربیت پرداخته شده است. سپس هفت ویژگی طلبه جامع تبیین شده و نقش مدارس در تربیت طلاب مورد تاکید قرار گرفته است. و در ادامه این فصل بیانیه ماموریت و بیانیه ارزشهای مدرسه علمیه مطلوب ارائه شده است. پسازآن، در ضمن دو فصل به تبیین راهبردهای تحقق تربیت جامع پرداخته و در ذیل هر راهبرد راهکارهای پیادهسازی آن راهبرد بیان شده است. راهبردهای فرهنگی ـ تهذیبی و راهبردهای آموزشی ـ پژوهشی عناوین فصلهای دوم و سوم این کتاب هستند. با توجه به این که دستیابی به این راهبردها در مدارس علمیه نیازمند نظام مدیریتی متناسب با آن است، در فصل چهارم راهبردها و راهکارهای مدیریتی مورد بحث قرار گرفته است. در بخش پایانی این کتاب، مجموعهای از اسناد ارزشمند و کاربردی در قالب پیوستها آمده است.