شکل گیری مدرسه حفاظ
در سال 1379 هجری شمسی به دنبال آغاز نهضت قرآن‌آموزی در کشور و با ظهور نابغه قرآنی سید محمدحسین طباطبایی (علم الهدی) جمعی از فضلای حوزه علمیه اقدام به تأسیس مدرسۀ علمیۀ ویژۀ حافظان قرآن کریم نمودند. این مدرسه که «مدرسه علمیه قرآنی امام جواد(علیه‌السلام)» نام داشت در واقع اولین مدرسه علمیه ویژه حفاظ قرآن کریم در کشور بود که به همت اساتیدی همچون حجة‌الاسلام و المسلمین حسن مولایی، حجة‌الاسلام و المسلمین محمود مقدمی، حجة‌الاسلام و المسلمین محمدتقی ربانی و حجة‌الاسلام و المسلمین سید محمدمهدی طباطبایی (پدر نابغه قرآنی سید محمدحسین طباطبایی) تأسیس شد. مدرسه علمیه «امام جواد علیه‌السلام» پس از مدت کوتاهی به دلیل تغییر مکان مدرسه و انتقال آن به مدرسه‌ای که تحت اشراف حضرت آیت‌الله العظمی گلپایگانی(قدس‌سرّه) بود، با نام «مدرسه علمیه قرآنی المهدی(عجل‌الله‌فرجه)» شناخته شد.
در سال 1385 هجری شمسی مدرسه علمیه قرآنی به بنای نوساز موجود (مکان فعلی) در خیابان شهید قدوسی(ره) واقع در بلوار عمار یاسر منتقل شد. مدرسه علمیه قرآنی پس از انتقال به ساختمان جدید با نام «مدرسه علمیه قرآنی امام علی بن موسی الرضا(علیه‌السلام) -ویژه حافظان قرآن کریم» شناخته می‌شود.
مدیران مدرسه علمیه قرآنی امام علی‌بن موسی الرضا(علیه‌السلام) از ابتدا تا امروز:
- حجة‌الاسلام و المسلمین مولایی
- حجة‌الاسلام و المسلمین مقدمی
- حجة‌الاسلام و المسلمین نمازی
- حجة‌الاسلام والمسلمین سمیعیان
تا کنون بیش از 1000 طلبه در این مدرسه به همت اساتید برجسته‌ای همچون آیت‌الله نیازی، مرحوم مسلم قلی‌پور گیلانی (شهید منا)، استاد فتوحی، استاد دباغ، استاد نصراللهی، استاد طباطبایی، استاد عرفان شهررضایی، استاد سمیعی‌فرد، استاد فروغی، استاد فربهی، استاد قائمی و در ظل توجهات بزرگان حوزه همچون آیت‌الله خزعلی قدس‌سره، آیت‌الله مهدوی کنی قدس‌سره، آیت‌الله اراکی، آیت‌الله خاتمی، آیت‌الله حسینی بوشهری، آیت‌الله ترابی قدس‌سره و آیت‌الله توکل فارغ التحصیل شده‌اند و هم‌اکنون نیز 125 طلبه مشغول به تحصیل در این مدرسه می‌باشند.